Theo Ủy ban Kiểm tra Trung ương ngày 22/6, do ông Huỳnh Thanh Tùng trong lãnh đạo, chỉ đạo, điều hành đã vi phạm nghiêm trọng quy định của Đảng, pháp luật của Nhà nước về đất đai: Báo cáo không trung thực về giá đất chuyển nhượng để chia tiền chênh lệch; vi phạm quy chế làm việc, quy chế dân chủ cơ sở; vi phạm về tài chính. Đồng thời phải chịu trách nhiệm trong việc trực tiếp chỉ đạo lập các thủ tục không đúng quy định để được cấp giấy chứng nhận quyền sử dụng đất.

Khuyết điểm, vi phạm của ông Huỳnh Thanh Tùng là nghiêm trọng, vi phạm Điều 8, Điều 9, Quy định 47-QĐ/TW về những điều đảng viên không được làm. Trong quá trình kiểm tra, ông Huỳnh Thanh Tùng đã báo cáo trung thực, và tự nhận hình thức kỷ luật, nghiêm túc nhìn nhận khuyết điểm, sai phạm, khắc phục một phần hậu quả.

Bởi vậy, ngày 3/6/2021, Tỉnh ủy Kiên Giang quyết định kỷ luật Thượng tá Huỳnh Thanh Tùng, đảng viên, Phó Đội trưởng Đội K92; nguyên Đảng ủy viên, nguyên Ủy viên Ban Thường vụ Huyện ủy, nguyên Chỉ huy trưởng Ban chỉ huy Quân sự huyện Vĩnh Thuận nhiệm kỳ 2015-2020 bằng hình thức Cách chức tất cả các chức vụ trong Đảng nhiệm kỳ 2015-2020.