Theo HĐXX, các bị cáo đều là những người có chức vụ, hiểu và biết về những quyền hạn của mình đang nắm giữ nhưng đã không thông qua HĐQT, tự ý quyết định sử dụng 1.000 tỷ đồng chuyển cho Công ty Đô Thị Mới và Công ty Đại Á để hợp tác đầu tư. Sau đó, tự ý giảm lợi nhuận về 0% là nguyên nhân khiến Saigon Co.op thiệt hại hơn 115 tỷ đồng.

Hành vi của các bị cáo là đặc biệt nghiêm trọng, gây thất thoát lớn cho nhà nước, làm suy yếu cơ quan tổ chức, cần phải xử lý nghiêm để răn đe, phòng ngừa chung.

Tuy nhiên, các bị cáo đều thành khẩn khai báo, một số người đã tự nguyện khắc phục hậu quả nên sau khi xem xét, HĐXX quyết định tuyên phạt bị cáo Diệp Dũng 10 năm tù; bị cáo Nguyễn Thành Nhân  (cựu Tổng giám đốc, thành viên HĐQT Saigon Co.op) 5 năm tù;  bị cáo Hồ Mỹ Hòa (cựu giám đốc Phòng Tài chính Saigon Co.op) 3 năm tù.

Bị cáo Võ Thành Trung (cựu Tổng giám đốc Công ty Đầu tư Phát triển Đô Thị Mới) và Tôn Thất Hào (cựu Tổng giám đốc Công ty Địa ốc Đại Á) cùng 5 năm tù.

4 bị cáo nguyên là thuộc cấp của bị cáo Diệp Dũng cũng bị tuyên phạt từ 2-3 năm tù giam.

Cáo trạng thể hiện, với vai trò là Chủ tịch HĐQT nhưng không thông qua HĐQT của Saigon Co.op, bị cáo Diệp Dũng đã tự ý ký hợp đồng hợp tác với Công ty Đại Á số tiền 300 tỷ đồng và hợp đồng hợp tác đầu tư với Công ty Đô Thị Mới số tiền 700 tỷ đồng; ký ủy nhiệm chi 1.000 tỷ đồng trong số 3.000 tỷ đồng của Saigon Co.op huy động vốn để thực hiện thương vụ mua lại chuỗi siêu thị Big C và mở rộng mạng lưới Saigon Co.op (là tài sản của Saigon Co.op) cho Công ty Đại Á và Công ty Đô Thị Mới.

Theo hợp đồng hợp tác đầu tư với 2 công ty này, Saigon Co.op được nhận tỷ lệ lợi nhuận cố định 7%/năm. Tuy nhiên, sau đó bị cáo Diệp Dũng cũng tự ý ký thỏa thuận bổ sung điều chỉnh tỷ lệ lợi nhuận từ 7%/năm xuống còn 0%/năm, gây thiệt hại cho Saigon Co.op hơn 115 tỷ đồng (trong đó thiệt hại về thuế là gần 30 tỷ đồng).